生物计算领域迎来重磅开源力量。字节跳动近日正式发布了名为Protenix-v1的生物分子结构预测模型。该模型不仅完整复现了 AlphaFold3（AF3）的核心能力，更宣布在 Apache2.0协议下全面开源代码及模型参数，打破了顶尖生物大模型的技术围垒。
Protenix-v1的强大之处在于其全原子3D 结构预测能力，能够精准处理包括蛋白质、核酸（DNA 和 RNA）以及小分子配体在内的复杂生物系统。根据 AIbase 了解，这是首个在相同训练数据、模型规模及推理预算下，性能表现能够达到甚至在多项基准测试中超越 AlphaFold3的全开源模型。
为了确保评估的公正透明，字节跳动同步推出了PXMeter v1.0.0评测工具箱，涵盖了超过6000个复杂的分子样本，为行业提供了可复现的标准基准。该项目还提供了一个基于浏览器的 Web 服务器，方便科研人员直接进行交互式研究。AIbase 认为，Protenix-v1的开源将极大地加速药物研发和合成生物学等前沿领域的创新进程。
